环境准备： open-master 管理登录节点 192.168.29.12 open-node01 管理登录节点 192.168.29.13 操作系统： Centos7-2009 禁用防火墙，关闭selinux 安装LADP master 安装软件 yum install openldap* yum install migrationtools …

下载HPL软件 wget https://www.netlib.org/benchmark/hpl/hpl-2.3.tar.gz --no-check-certificate 安装OpenBLAS git clone https://github.com/xianyi/OpenBLAS.git cd OpenBLAS && make…

检查GLIBC版本 strings /lib64/libc.so.6 |grep GLIBC_ 前置安装 yum install gcc gcc-c++ bzip2 zlib-devel bison python36 -y 升级GNU Make 4.3 tar -xvf make-4.3.tar.gz cd make-4.3 mkdir build…

安装包准备 vasp.5.4.4.tar.gz vtstscripts.tgz vtstcode-195.tgz VASPsol-1.0/pbz_patch_541 加载intel2018编译器 如果不知道怎么安装intel2018编译，查看文章：https://www.ihaoyu.net/?p=103 module load intel/201…

上传软件包到服务器 解压软件，执行install tar -xf BIOVIA_2019.MaterialsStudio2019.tgz cd MaterialsStudio2019/ ./install 因为是集群要用，所以不使用RPM方式安装。 指定安装位置 下一步，下一步 进入安装状态 可能会遇到的错误 yum install csh -y …

上传软件包到服务器 parallel_studio_xe_2018_update4_cluster_edition.tgz 解压软件包，使用GUI模式安装 tar -xf parallel_studio_xe_2018_update4_cluster_edition.tgz cd parallel_studio_xe_2018_update4_cl…

安装依赖 yum groupinstall 'Development Tools' -y yum install hwloc hwloc-devel gtk2-devel gtk2 pam libevent-devel pam-devel numactl-devel readline-devel lua-devel hdf5-devel.x86_6…

conda 使用方法 设置国内源加速 vim .conda/.condarc ——————————————— channels: - defaults show_channel_urls: true default_channels: - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main…

双机互信 检查双机互信 在WEB界面中，连接到master的shell终端。分别连接到计算节点。如图： 如果发现，连接到计算节点需要密码？那就是没做双机互信。 ssh-keygen 生成秘钥对 ssh-keygen #输入命令后一直按回车到最后就行 如果一次秘钥都没生成过，就是上图的界面。如果是下图的界面，那么说明你之前生成过秘钥对，直接选Y覆盖就…

因为服务器的软件编译，例如调度系统，分布式文件系统，存储系统，作业系统；都是基于Centos7进行编译，系统GCC为4.8.5，GLIBC为2.17，如何升级GLIBC，可能会导致这些软件故障，无法使用。（甚至会导致系统无法启动）所以使用容器方式提交作业是最稳定的方式。 如何使用singularity 创建镜像？（singularity build…